> バスラインに名称をつけてPDFにすると線幅が信号線とおなじ線幅になってしまうのですが仕様でしょうか？
> 名称をつけない場合、線幅が太くなります。
> よろしくお願いします

不具合です。
一度ファイルを保存して、開きなおしてからＰＤＦ変換を実行してください。